Ученые СПбГАУ предложили способ выявления инфекций рыб менее чем за два часа

Ученые СПбГАУ предложили способ выявления инфекций рыб менее чем за два часа

Бактериальные и вирусные инфекции способны быстро распространяться в рыбоводных хозяйствах и приводить к массовой гибели рыбы. Ученые Санкт-Петербургского государственного аграрного университета создали тест-систему, которая сможет одновременно определять от шести до восьми ключевых возбудителей, а результат исследования выдавать менее чем за два часа.

Разработка основана на количественной ПЦР — молекулярно-генетическом методе, который позволяет находить в биологическом материале характерные участки ДНК или РНК возбудителя. В перечень потенциальных мишеней входят бактерии Aeromonas hydrophila, Flavobacterium columnare, представители рода Pseudomonas, вирус геморрагической септицемии и другие патогены лососевых и осетровых рыб.

Сейчас для установления причины заболевания могут потребоваться несколько отдельных исследований. Традиционные методы диагностики также нередко предполагают продолжительные лабораторные процедуры и не всегда позволяют обнаружить трудно культивируемые микроорганизмы или инфекцию на ранней стадии.

Предлагаемая тест-система должна проводить одновременный поиск нескольких бактериальных и вирусных возбудителей в рамках одного анализа. Целевые характеристики проекта предусматривают чувствительность более 95% на ранних стадиях заболевания и получение результата менее чем за два часа.

«Большинство существующих решений рассчитано на выявление отдельных возбудителей, поэтому для получения полной картины приходится проводить несколько исследований. Наша задача — объединить в одной тест-системе диагностику наиболее опасных бактериальных и вирусных инфекций. Это поможет быстрее определить причину заболевания, локализовать очаг и не допустить распространения инфекции в хозяйстве», — рассказал руководитель проекта, доцент СПбГАУ Сергей Скляров.

Разработку планируется использовать в ветеринарных лабораториях, референтных центрах и на предприятиях аквакультуры. Она может применяться для раннего выявления инфекций, различения заболеваний со схожими признаками, контроля эффективности лечения и профилактических мероприятий, а также для эпизоотического мониторинга.

Отдельное направление работы связано с адаптацией тест-системы к практическим условиям рыбоводческих хозяйств. Разработчики планируют определить оптимальный способ подготовки проб, сформировать набор праймеров и зондов, после чего провести валидацию и апробацию технологии на предприятиях аквакультуры.

Патентные исследования не выявили документов, которые могли бы препятствовать применению результатов проекта на территории России. Анализ существующих решений также показал востребованность комплексных наборов, способных одновременно обнаруживать несколько бактериальных и вирусных патогенов.

В команду проекта вошли специалисты СПбГАУ в области ветеринарии, ихтиопатологии, молекулярной биологии и биоинформатики: доцент кафедры крупного животноводства СПбГАУ Сергей Скляров, профессор кафедры водных биоресурсов и аквакультуры Тамара Нечаева, специалист-биоинформатик Екатерина Пономарева и профессор кафедры крупного животноводства СПбГАУ Лариса Ильина.

Проект реализуется в рамках Программы развития проектов технологического лидерства «От идеи к продукту». Заинтересованность в его реализации выразило Управление ветеринарии Ленинградской области: применение тест-системы может повысить оперативность ветеринарного мониторинга, помочь своевременно локализовать инфекции и снизить экономические потери рыбоводческих хозяйств.

Указанный проект прошел в очный этап программы «От идеи к продукту»: по итогам отбора туда попала 201 команда из 1061. На встрече в Москве 10–12 сентября участники вместе с экспертами уточнили методику реализации разработки и обсудили ее применение. Далее проект рассмотрит экспертный совет программы.